2008年，该刊全年出版6期215篇论文，共约194.3万字，载文量215篇。其中，受国家级基金项目资助的52篇，省市级基金项目资助的有46篇，合计基金资助论文98篇。另以特刊形式出版增刊约17.6万字。

在2008年版《中国学术期刊综合引证报告》（科学出版社）中，该刊2007年的影响因子为0.391，总被引频次为1026次，被引半衰期6.5年。2008年，该刊继续被入编2008版《中文核心期刊要目总览》，为综合性医药卫生类核心期刊，并获教育部科学技术司“中国高校优秀科技期刊奖”。

《复旦学报（医学版）》是教育部主管、复旦大学主办的向国内外公开征稿和发行的综合性医药卫生类学术性核心期刊。本刊被下列国内外权威数据库收录：波兰《哥白尼索引》（IC, Index of Copurnicus）；俄罗斯《文摘杂志》（AJ，Abstracts Journal，VINITI）；荷兰爱思唯尔公司《斯高帕斯数据库》（Scopus）；美国《乌利希期刊指南》（Ulrich PD,Ulrich's Periodicals Directory）；美国《生物学文摘（预评）》（BAP，BIOSIS Previews）；美国《化学文摘》（CA，Chemical Abstracts）；美国《剑桥科学文摘》（ProQuest CSA）；中国科学引文数据库（CSCD）核心库；中国科技论文与引文数据库；中国期刊全文数据库；中文科技期刊数据库；万方数据资源系统；中文核心期刊要目总览等。

中国核心期刊

2、论文无一稿多投，文责自负，并同意编辑部作必要的文字修改；

3、涉及人体研究的应说明程序合法、得到相关伦理委员会批准及受试者知情同意，涉及动物的研究也需注明喂养符合相关标准和程序、实验过程符合相关保护法；

4、原创性论文其科研设计及数据处理需经统计学专家认可，英文摘要及涉及英文的内容也需经过相关专家认定；

5、来稿应具科学性、逻辑性、先进性和实用性，目的明确、内容翔实、数据可靠、结论合理，文字需简洁通顺、逻辑合理，图表需规范表达，全文应前后呼应，观点明确。论著和实验研究报道类文稿字数一般限5000~6000字以内(包括图表、参考文献和结构式中英文摘要)；临床经验交流和方法技术类文稿字数一般限4000字以内(包括图表、参考文献和结构式中英文摘要)；临床病理（例）讨论、个案报告及短篇报道一般限1000~1500字以内，讲座及综述则视内容而定。全英文稿件请同时附上中文题名和摘要。